北京市心肺血管疾病研究所1981年9月2日由我国已故心血管疾病专家吴英恺院士创建。1984年经北京市科委和相关政府机构批准,正式列为市属独立科研机构。2007年10月重新归属北京市卫生局科教处。是目前北京市卫生局所属研究机构中一家以心、肺血管疾病防治的应用基础研究为主要方向的公益性研究所。